Robotnik se va por unos días para combatir a los guerrilleros de la frontera norte y Snively queda al mando de Robotropolis. Más tarde, en dicha ciudad, Sonic se infiltra en la base central y logra salvar a un grupo de guerrilleros capturados que iban a ser robotizados. Sin embargo, uno de los robots de la sala de robotización utiliza un rifle de rayos de amnesia para borrarle la memoria al erizo. El confundido Sonic es llevado ante Snively, quien le dice que él es su jefe y su mejor amigo, y que el erizo es parte de las fuerzas que protegen la ciudad de los "guerrilleros de la libertad", un grupo de anarquistas que quieren destruirla. Snively le ordena a sonic que utilice su súper velocidad para viajar al gran bosque y encontrar el escondite de los guerrilleros. Snively le da al erizo un comunicador para que cuando encuentre la guarida, le revele su ubicación exacta. Sonic parte al gran bosque, decidido a cumplir con la misión encargada por su "jefe".